重组MIX是一款简单、快速、高效的多片段DNA定向克隆产品,本试剂盒可以将PCR产物定向克隆至任意载体的任意位点。将载体在克隆位点进行线性化,并在插入片段PCR引物5’端引入线性化克隆载体末端序列,使得插入片段PCR产物5’和3’最末端分别带有和线性化克隆载体两末端对应的完全一致的序列(20 bp~40 bp)。将这种两端带有载体末端序列的PCR产物和线性化克隆载体按一定比例混合,在重组酶的催化下,仅需反应15-60 min即可进行转化,完成定向克隆。克隆阳性率可达90%以上。
试剂盒中2×重组MIX预混了重组酶和重组反应所需缓冲液,并添加了特殊成分,可显著提高重组克隆效率,可以一次实现多至6个片段的顺序拼接克隆。
应用:
• 多片段克隆到目标载体
• 多片段组装后作为PCR或RCA的模板
产品特点:
• 简单高效的定向无缝克隆
• 灵活的序列设计,无需考虑酶切位点
• 无需PCR纯化步骤
• 可同时进行最多6个DNA片段的组装
质量控制检测 :
使用Positive control组装五个DNA片段,涂布于CI抗性平板上,最终用菌落PCR或质粒酶切验证,阳性克隆达到87.5%及以上。
使用说明
1、反应体系
冰上配制如下反应体系。
2×重组MIX 10 μL
线性化克隆载体 A ng
插入片度(PCR扩增产物 ) B ng
ddH2O Up to 20μL
注:如果不慎将液体粘在管壁,可通过短暂离心使其沉入管底;
重组Mix重组反应体系最适DNA使用量为每线性化片段0.03pmol。该摩尔数对应的DNA质量可由以下公式计算获得:片段添加量(ng)= 0.02×片段碱基对数(bp)(对应的片段浓度为0.03 pmol)。
2、重组反应
(1)在冰上解冻2×重组Mix,颠倒混匀。
(2)在无菌管中加入载体和片段(按上述要求),用无菌水补足到10μL,最后加入10 μL 2×重组Mix,用移液器轻轻吸打混匀避免气泡产生。
(3)50℃恒温反应15-50min,2-3个片段15min反应即可,4-6个片段需反应60min,在冰上放置3-5min。
3、转化
(1)取化学转化感受态细胞于冰上解冻。
(2)取上述反应液10 μL加入到感受态细胞中充分混匀。冰浴10min。
(3)将离心管置于42℃水浴锅中热激90s,然后迅速放回冰上,使细胞冷却2~3min。
(4)向离心管中加入已预热的无菌LB(或SOC)培养液600μL,37℃恒温振荡培养45~60min。
(5)短暂离心弃上清,吸取100 μL的新鲜LB培养基重新悬浮,将菌液均匀涂布在含有适当抗生素的平板上。将平板倒置,于37℃过夜培养。
4、 克隆鉴定
菌落PCR。用无菌的枪头或牙签将单个菌落挑至20~50μL LB 培养基中混匀,直接取1μL作为PCR模板,使用2×Taq DNA Polymerase Master进性菌落PCR实验。
注意事项
• 为达到最优的重组效果,请保证体系中PCR片段和载体的质量,建议DNA样品A260/280>1.8,浓度>40ng/ul。
• 多片段重组时,相邻两个DNA片段有互不相同的20-40bp同源序列,确保定向组装。同源序列的长度由片段数目和长度决定,多片段重组建议设计40bp同源序列。同源序列需要避免重复序列、复杂二级结构以及高低GC区域。
• 当得到的PCR产物条带单一时,可无需纯化,产物可直接用于重组,注意产物添加量不可超过重组体系的1/10。
• EDTA等金属离子螯合剂对该产品有抑制作用,必须保证反应体系中不含该类螯合剂。